与传统无机肥相比，生物有机肥料的优点是：

一是生物鱼肥的氮、磷含量高，水溶性好，添加了水生生物必需的铁、锌、镁、铜、钻、铝、硒等系列微量元素，从而提高肥效并能激活有益藻、益生菌的生物酶活性，加强其同化作用，加快其繁殖和生长速度，保证水产动物有丰富的天然饵料。

二是生物鱼肥富含生物有机酸如腐殖酸、胡敏酸、乌敏酸等，既具有传统有机肥肥效持久的优点，又能提高水生植物的生理活性，而且不产生有机渣质，对水体和底质没有污染，因此投入泥鳅池塘后就显得非常干净卫生。

三是生物鱼肥里添加的生物活性物质，能促进泥鳅消化藻类，抑制有害藻、有害菌的繁殖和生长，同时具有增加溶解氧的作用，还能降低氨氮、亚硝酸盐、硫化氢等有害物质的含量，对于净化水质、改善底质、保持水环境的生态平衡具有重要作用。另外这种生物活性物质还能有效地预防鳅池发生浮头泛池的现象，可以提高泥鳅的活力。

四是用量少而准确、见效快而持久、肥效比高。既能促进泥鳅的生长、发育，又减少病害，有效提高施肥的直接效益和综合效益。

为了方便说明，这里列简表对生物鱼肥与各类肥料进行比较（表2）,这种比较只是一种参考，养殖户在具体的养殖过程中还是要根据当地的肥料来源、使用习惯、养殖成本等综合考虑。